Una IA entrenada con datos genómicos puede escribir código genético de cero

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27 FEB 2025

Una IA entrenada con datos genómicos puede escribir código genético de cero

 

En los últimos tiempos se han producido avances relevantes en herramientas de inteligencia artificial (IA) para predecir la estructura tridimensional de biomoléculas; y se trabaja en la aplicación de modelos para diseñar proteínas a la carta como, por ejemplo, moléculas con capacidades terapéuticas.
Recientemente, una noticia publicada en la revista Nature se hacía eco del que podría ser el modelo de IA más potente en biología, capaz de facilitar el desarrollo de genomas completos desde cero. Se trata de Evo 2, y ha sido desarrollado por investigadores del Arc Institute de EE.UU. y del fabricante de chips NVIDIA, en colaboración con expertos de la Universidad de Stanford y de la Universidad de California en Berkeley y San Francisco.
Las características de Evo 2 se describen en un artículo publicado en la plataforma de preprints bioRxiv, de modo que el trabajo todavía no ha superado una revisión por pares. Según recoge un post en el blog del Arc Institute, el modelo se ha entrenado con más de 9,2 billones de pares de bases de 128.000 genomas completos de todo el espectro de la vida, desde procariotas como arqueas y bacterias hasta eucariotas como levaduras, plantas y animales.
 
 
El modelo de IA puede aprender sobre la complejidad del genoma por sí solo
 
 
Según los autores, gracias a este entrenamiento con datos genómicos masivos, Evo 2 es capaz de aprender las complejidades de la información almacenada en el ADN por sí solo, como, por ejemplo, los límites entre intrones y exones, dianas de unión de factores de transcripción y elementos clave para la estructura de proteínas.
También puede predecir el impacto de variantes genéticas sobre la funcionalidad a nivel de ARN, proteína u organismo. Por ejemplo, el modelo tuvo una precisión del 90% a la hora de clasificar como inocuas o patogénicas variantes conocidas del gen BRCA1, que se relaciona con el cáncer de mama. Así mismo, Evo 2 puede generar nuevas secuencias genéticas de cero y elaborar pequeños genomas completos, como los de bacterias y levaduras.
Por todo ello, los autores consideran que el modelo puede ser de utilidad para diseñar nuevas herramientas en biología o incluso nuevos tratamientos. Evo 2 es totalmente abierto y está disponible para toda la comunidad científica con el objetivo de que especialistas de diversos ámbitos lo pongan a prueba, y también para que puedan adaptarlo a sus propias necesidades.
Fuente: Arc Institute.
Referencia
Callaway E. Biggest-ever AI biology model writes DNA on demand. Nature. 2025;638(8052):868-869.doi:10.1038/d41586-025-00531-3
Brixi G, Durrant MG, Ku J, et al. Genome modeling and design across all domains of life with Evo 2. bioRxiv>/em>. 2025.02.18.638918. doi:10.1101/2025.02.18.638918
OAD-ES-AMG-0001
 

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