Los grandes modelos de lenguaje, como ChatGPT o Gemini, han sido entrenados con infinidad de textos humanos para aprender a generar y procesar el lenguaje de forma convincente. No obstante, los algoritmos de aprendizaje automático (AA) subyacentes en dichos modelos pueden ser entrenados con otro tipo de información, como secuencias proteicas o genómicas, y
ayudar así a generar proteínas o ácidos nucleicos desde cero.
En una
noticia, la revista
Nature se hace eco de los resultados de dos trabajos recientes en los que se ha recurrido a modelos de IA generativa entrenados con datos biológicos para diseñar nuevos complejos CRISPR-Cas9 de edición genética.
Estos nuevos sistemas CRISPR podrían ayudar a superar algunos de los inconvenientes que presentan los complejos identificados en la naturaleza, como las limitaciones en cuanto a las secuencias que se pueden editar y los
efectos no deseados fuera de la localización diana.
Ambos trabajos se han dado a conocer en preprints, de modo que no han sido publicados todavía en una revista científica al uso ni han superado una revisión por pares.
Los sistemas CRISPR sintéticos podrían ayudar a superar las limitaciones de los identificados en la naturaleza
En el
estudio más reciente, se usó un modelo de lenguaje proteico desarrollado por los propios autores que se entrenó específicamente con secuencias de modelos CRISPR. Además, también se desarrolló un modelo de IA para generar el ARN guía que dirige a la nucleasa Cas9 al lugar donde se va a producir la edición.
Los investigadores sintetizaron más de 200 complejos CRISPR diseñados por el algoritmo de IA, y en pruebas de laboratorio muchos fueron capaces de editar la localización prevista del genoma. De hecho, el sistema más eficiente de los evaluados, bautizado como OpenCRISPR-1, está disponible para su uso por parte de la comunidad científica.
El
otro trabajo recurrió a un algoritmo de AA capaz de generar tanto secuencias de ácidos nucleicos como de proteínas para generar complejos moleculares CRISPR-Cas9 sintéticos. Los resultados de los diseños no se han testeado en el laboratorio, pero muchas de las estructuras tridimensionales predichas eran similares a las de los complejos existentes en la naturaleza.
OAD-ES-AMG-0001
Aceptar y salir
